Tại cuộc họp báo, Phó Trưởng ban Thường trực Ban Tôn giáo Chính phủ Nguyễn Thanh Xuân cho biết chính sự khác biệt về lối tu của Làng Mai với cách tu tập của tăng, phật tử tại Tu viện Bát Nhã theo lối truyền thống của Phật giáo Việt Nam đã dẫn đến những xung đột về văn hóa, châm ngòi cho những vụ va chạm ở Tu viện Bát Nhã.Trước tháng 6/2008, những người Việt Nam tu theo pháp môn Làng Mai tụ tập tại tu viện Bát Nhã theo những khóa tu ngắn ngày có sự bảo lãnh của Thượng tọa Thích Đức Nghi, Trụ trì tu viện Bát Nhã. Thiền sư Thích Nhất Hạnh đã bổ nhiệm Phó Trụ trì Tu viện Bát Nhã, tấn phong giáo phẩm cho một vị từ Thượng tọa lên Hòa thượng mà không qua ý kiến trụ trì Tu viện Bát Nhã và Giáo hội Phật giáo Việt Nam (GHPGVN). Do bức xúc bởi việc này, ngày 1/9/2008, Thượng tọa Thích Đức Nghi có đơn không bảo lãnh cho những người tu theo pháp môn Làng Mai ở lại đây. GHPGVN đã có văn thư đề nghị nhóm người đi tu thôi không tập trung tụ tập tại Bát Nhã mà về các chùa thuộc địa phương có nơi hộ khẩu thường trú để tu học. Chính quyền cũng đồng ý với hướng giải quyết của GHPGVN. Tuy nhiên, những người tu theo pháp môn Làng Mai tại tu viện Bát Nhã, Lâm Đồng không thực hiện. Ngày 27/6/2009, một số tăng, phật tử của tu viện Bát Nhã đã xô xát với số người tu theo pháp môn Làng Mai. Nhiều lần Thượng tọa Thích Đức Nghi yêu cầu số người tu theo pháp môn Làng Mai rời khỏi Bát Nhã nhưng họ vẫn tiếp tục ở lại. Mu thuẫn giữa các vị tăng và phật tử tu viện Bát Nhã với những người tu theo pháp môn Làng Mai không rời khỏi tu viện Bát Nhã dẫn đến việc xô xát ngày 27/6/2009 giữa số người tu theo pháp môn Làng Mai và các tăng, phật tử của Tu viện Bát Nhã. Đến ngày 28/9/2009, toàn bộ số người tu theo pháp môn Làng Mai mới rời khỏi Bát Nhã đến ở tạm tại Chùa Phước Huệ (Bảo Lộc, Lâm Đồng), một số người khác trở về địa phương. Và đến ngày 30/12/2009, số người còn lại này đã tự rời khỏi Chùa Phước Huệ, về nơi cư trú. Hiện tại chính quyền địa phương chưa nắm được tất cả số lượng cũng như nơi đến cụ thể của những người này sau khi rời khỏi Chùa Phước Huệ. Phó Chủ tịch UBND tỉnh Lâm Đồng Nguyễn Ngọc Đông cũng cho hay: "Chính quyền địa phương coi đây là việc mâu thuẫn nội bộ giữa sư, phật tử thuộc tu viện Bát Nhã và số người tu theo pháp môn Làng Mai tại Bát Nhã".. Chính quyền địa phương chỉ thực hiện công tác đảm bảo an ninh trật tự, hòa giải các mâu thuẫn theo chức năng nhiệm vụ đã được quy định. Thông tin cho rằng chính quyền địa phương đã gây sức ép buộc nhóm người tu theo pháp môn Làng Mai phải rời bỏ Chùa Phước Huệ là hoàn toàn sai sự thật Trong vụ việc những người tu theo pháp môn Làng Mai tại Bát Nhã có trách nhiệm của Thiền sư Thích Nhất Hạnh, cụ thể Thiền sư đã bổ nhiệm Phó Trụ trì tu viện Bát Nhã, tấn phong giáo phẩm Hòa thượng cho một vị sư của Việt Nam mà không thông qua Trụ trì tu viện Bát Nhã và GHPGVN. Trong vụ việc những người tu theo pháp môn Làng Mai tại Bát Nhã có trách nhiệm của Thiền sư Thích Nhất Hạnh, cụ thể Thiền sư đã bổ nhiệm Phó Trụ trì tu viện Bát Nhã, tấn phong giáo phẩm Hòa thượng cho một vị sư của Việt Nam mà không thông qua Trụ trì tu viện Bát Nhã và GHPGVN. Thứ trưởng Bộ Ngoại giao, Chủ nhiệm Ủy ban Nhà nước về người Việt Nam ở nước ngoài Nguyễn Thanh Sơn đã chủ động thông tin với Làng Mai trước một tháng, trong chuyến công tác tại Pháp (cuối tháng 9, đầu tháng 10/2009). Thứ trưởng đề nghị được gặp Thiền sư Thích Nhất Hạnh để bàn giải quyết việc những người tu theo pháp môn Làng Mai tại Lâm Đồng. Tuy nhiên, Thiền sư đã từ chối với lý do đã có chương trình sang Mỹ hoạt động tôn giáo.

Nguyễn Hoàng